佛罗伦萨陷入灭城危机，洛伦佐身受重伤，美第奇家族陷入群龙无首的衰败局面。达芬奇一方面要设法扶助美第奇家族，一方面要击退帕奇家族，却可能错过寻找“叶之书”的机会。利拉奥伯爵捷足登船，暗中设伏，打算比达芬奇早一步夺取“叶之书”。